Ik ben toevallig aan een seminarie over flowcytometrie bezig. Dit houdt in dat X - en Y -dragend sperma van elkaar gescheiden wordt op basis van het verschil in grootte. Hiervoor is een fluorochroom nodig. Ik geef je een klein stukje uit mijn seminarie, je kan het misschien als voorbeeld gebruiken voor een concrete toepassing
"Om het verschil in genoomgrootte tussen cellen te meten, worden de nuclei gemerkt met een specifiek fluorochroom en dan één voor één door een lichtbron van hoge intensiteit (meestal een laserstraal) gestuurd. De fluorescentie die dan wordt uitgezonden is recht evenredig met de hoeveelheid DNA die deze cel bevat.
Als merker wordt meestal Hoechst 33342 gebruikt. Deze heeft een lage cytotoxicteit en gaat binden aan adenine en thymidine zonder te intercaleren. Dit is van groot belang om mutagene schade zo veel mogelijk te vermijden. In 1988 werd door Johnson en Clarke aangetoond dat de nuclei van spermacellen, die gesorteerd werden met Hoechst 33342 aan het DNA gebonden, tot fertilisatie in staat waren. Dit impliceert dat het replicerende DNA functioneel was in aanwezigheid van de gebonden merker en dat het de flowcytometrische condities kon doorstaan."
Maw Hoechtst 33342 gaat binden aan het DNA en wordt dan geëxciteerd door de ultra-violette laserstraal waardoor er fluorescentie uitgezonden wordt.