Puzzel Puzzels
wetenschappers
Artikelen: 0
Berichten: 142
Lid geworden op: wo 18 jul 2012, 17:14

shotgun sequencing

Kan iemand me uitleggen hoe shotgun sequencing , om de sequentie van een volledig genoom te bepalen, precies werkt? 
Ik ben niet zeker of ik alle stappen juist interpreteer. 
Volgens mij wordt eerst uw dna geëxtraheerd. Vervolgens gaat men het knippen met restrictie-enzymen in verschillende fragmenten. Die verschillende fragmenten worden vervolgens gescheiden volgens hun grote door gebruik te maken van agarosegelelektroforese. Elk fragment wordt vervolgens gekloneerd met behulp van een vector. De gekloneerde fragmenten worden vervolgens terug geëxtraheerd en elk geknipt in verschillende fragmenten met behulp van restrictie-enzymen. Die fragmenten worden vervolgens weer gescheiden volgens grootte en weer gekloneerd. De klones worden opgeslagen in een bibliotheek en via sequentie-analyse kan men vervolgens de overlap bepalen tussen de sequenties. Vervolgens worden ze op basis van hun overlap aan elkaar gezet. 
 
Dit is wat ik denk hoe het ongeveer in zijn werk gaat. Een aantal zaken zijn me echter nog niet duidelijk. Bv waarom de fragmenten moeten gescheiden worden volgens grootte? 
Ook snap ik het principe van Fysische kaarten niet. Zou iemand me deze werkwijze kunnen uitleggen? 
 
Alvast bedankt 

ads

Steun Sciencetalk Samsung Galaxy Tab A11 Plus - Wi-Fi - 128GB - Gray + 1 jaar extra garantie

Samsung Galaxy Tab A11 Plus - Wi-Fi - 128GB - Gray + 1 jaar extra garantie

Bekijk product

Steun Sciencetalk STABILO Power - Viltstift - Tot 8 Weken Zonder Dop - Etui Met 30 Kleuren

STABILO Power - Viltstift - Tot 8 Weken Zonder Dop - Etui Met 30 Kleuren

Bekijk product

Steun Sciencetalk Nintendo Switch 2 - Zwart

Nintendo Switch 2 - Zwart

Bekijk product

ads

Steun Sciencetalk Western Digital Elements Portable - Externe Harde Schijf - 6 TB

Western Digital Elements Portable - Externe Harde Schijf - 6 TB

Bekijk product

Steun Sciencetalk Logitech M185 - Draadloze Muis - Rood

Logitech M185 - Draadloze Muis - Rood

Bekijk product

Steun Sciencetalk bol cadeaukaart - 100 euro - Bedankt!

bol cadeaukaart - 100 euro - Bedankt!

Bekijk product

Gebruikersavatar
Wouter_Masselink
Artikelen: 0
Berichten: 8.560
Lid geworden op: ma 13 okt 2003, 09:54

Re: shotgun sequencing

Een physical genome map is een stuk genoom dat in silico is opgebouwd door verschillende stukken DNA dmv specifieke fingerprints met elkaar te combineren. Niet meer dan dit
Afbeelding
Het selectere van fragmenten van verschillend formaat was als eerste door Roach et al gedaan.
"Meep meep meep." Beaker
Scispace Scispace

Scispace is dé ai voor wetenschappers en onderzoekers. Ga naar SciSpace en profiteer van één van de beste ai's.

Scispace

Plaats een reactie

Je mail wordt niet openbaar getoond. Het wordt enkel gebruik voor contact of notificatie vanuit het beheer.

🗨️ Wat vind jij? Stel direct je vraag of geef je mening – zonder registratie. Je reactie zet het topic weer bovenaan bij 'Laatste posts' en trekt snel nieuwe reacties aan🔥. Mocht je als vaste bezoeker willen reageren, dan kun je je ook registreren.

Bevestig dat je geen robot bent door de volgende vragen te beantwoorden.

Noor heeft 10 knikkers. Ze verliest er 4 in het gras. Hoeveel heeft ze er nog?

Antwoord: (vul een getal in)

Er zitten 5 vogels op een hek. Twee vliegen weg. Hoeveel blijven er zitten?

Antwoord: (vul een getal in)

Terug naar “Moleculaire biologie en biochemie”

Sciencetalk: Leer, deel of groei. Volg of geef een cursus op Sciencetalk!