[Folding] Doe Mee Met Het Team Van [email protected]

[Jan van de Velde]

Voor zover ik weet alleen je processor. Hoe sneller je processor, hoe sneller hij vouwt. Ik heb hier een 1,5 GHz en een 800 MHz computer staan. Op vergelijkbare eiwittenen en bij vergelijkbaar ander werk vouwt de 1,5 Ghz ruim 3 x zo snel.

[Murk]

Zojuist geïnstalleerd, verloopt prima Ik begrijp dat het aantal frames per eiwit verschilt?

[WSF_Folding]

Hi Murk, tof dat je mee doet

Nog terugkomend op je vraag. Zoals Jan zegt, de snelheid van de processor is belangrijk. Maar ook de snelheid van het werkgeheugen. De hoeveelheid werkgeheugen telt ook, maar minder zwaar, want folding gebruikt niet zoveel werkgeheugen. Grote WU's vragen behoorlijk meer werkgeheugen (vgl. 6MB voor een P1808 en 110MB voor een P2412) Ook is de stabiliteit van het systeem belangrijk. Niet voor de snelheid, maar omdat folding alleen goed werkt op stabiele machines; het is dus niet verstandig om folding op (zwaar) overgeklokte machines te draaien. In de regel zijn die niet stabiel bij 100% load.

De snelheid waarmee je systeem een WU vouwt is afhankelijk van zowel de grootte als het type (dat is: type core: Amber, Gromacs, DGromacs, etc.) eiwit. De snelheid waarmee je systeem vouwt wordt uitgedrukt in PPD/GHz, dat is het aantal punten per dag per GHz. Je kunt o.a. een tabel met eiwitten en type systemen vinden op: http://www.fahinfo.org/index.php?avgscores=true

Vouw ze Murk

[Jan van de Velde]

Ja, er zijn werkeenheden (work-units, WU's) van een paar honderd frames, er zijn er ook van 50000. Die frames zijn echter niet altijd even omvangrijk. Een frame van een 50000-framer is op een vlotte computer in enkele seconden afgewerkt, een frame van een 500-framer kan makkelijk een aantal minuten in beslag nemen. Elke werkeenheid heeft zo zijn eigen tijd nodig op een standaard-computer, en aan de hand van die tijd worden de punten per WU berekend.

Ik moet trouwens eens een FAQ gaan (laten ) schrijven daarover, en over meer van dit soort standaard-vragen, want in de achterliggende 40 pagina's van dit topic komen dit soort vragen geregeld terug. (geen steek richting Murk, ik verwacht van niemand dat hij/zij 40 pagina's gaat doorzoeken op vragen die mogelijk niet eens aan de orde komen).

[Jan van de Velde]

Zie hier trouwens voor wat nuttige/leuke links:

http://sciencetalk.nl/forum/invision/in...d=245988#245988

[Jan van de Velde]

....................

En de honderdste staat erop!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!

Donator  Koen  

Team  Wetenschapsforum.nl (48658)  

Score  99    

WU 1    

Date of last work unit 2006-11-20 08:11:55  

[kombelpeter]

Geweldig. Honderd vouwende leden!

[Jan van de Velde]

laten we het eerlijkheidshalve zó stellen: 100 vouwende en gevouwen hebbende leden. Een kleine helft heeft al 50 dagen of meer niets meer ingeleverd.

En toch vind ik het leuk, want de meeste andere teams doen het op dit gebied véél beroerder.

[kombelpeter]

De motivatie is er in ieder geval.

[lucifer]

Ik heb zojuist 2 nieuwe vouwers gerecruteerd

[Jan van de Velde]

Ik heb zojuist 2 nieuwe vouwers gerecruteerd

goed voorbeeld doet goed volgen

[Reprisal]

meer statistieken

geeft meer motivatie

[Rov]

Ik zat ergens aan 4000/20000 (mij eerste WU) en nu is ie terug bij 0/20000 begonnen

[Jan van de Velde]

Zonde. Is het hetzelfde eiwit? Dan zit er een foutje in dat eiwit waarschijnlijk. Heb ik ook eens gehad, tot driemaal toe een herstart. Voor de zekerheid denk ik dat je het best je foldingmap INCLUSIEF bijbehorende werkmap met verkenner van je computer verwijdert, en folding opnieuw downloadt. Jammer, maar helaas.

Heeft in vergelijkbare gevallen altijd nog gewerkt.

[aaargh]

F@H crasht Half-Life 2: Deathmatch, mijn favoriete online spel en Just Cause, mijn favoriete off-line spel. Ik blijf vouwen, maar ik ga het wel uitzetten als ik begin te spelen.