Southern en northern blotting

[nikske]

In de cursus stond volgende vraag.

"Men maakt DNA van de nier en de dunne darm".

"Men maakt RNA van de nier en de dunne darm".

Men maakt zowel van DNA als RNA een blot.

Wat merkt u op.

Mijn antwoord zou zijn

Bij Een DNA mengsel werkt men met een Southern blot. Aangezien zowel niercellen als dunne darmcellen somatisch zijn, en dus een zelfde DNA bezitten zullen de verschillen tussen beide blots klein zijn tot nihil.

Bij de northern blot echter gaat men wel verschillen zien,daar de m-RNA's in niercel en dunne darmcel verschillen, aangezien elk hun specifieke eiwitten nodig hebben.

Klopt dit?

[Mrtn]

Wat je schrijft is grotendeels waar maar dat is niet zichtbaar op een blot. Dat is gewoon een stuk membraan en dat wordt pas interessant als je gaat proben. Wat je ziet ligt dus volledig aan de (gelabelde) probe die je gebruikt.

Met een oligo dT probe op je RNA blot (northern) zal je de poly-A staart van mRNA oppikken (voor zover dat intact is), met random hexa's zo'n beetje alle RNA/DNA en met specifieke sequenties pik je specifieke stukken op. Bijvoorbeeld alleen een van de stukken ribosomaal RNA of een bepaald gen.

(om even te mierenn*uken: overigens zou ik niet spreken van een "DNA mengsel", dat klinkt een beetje vreemd)