Hey, hoe zou je met behulp van een PCR kunnen aantonen dat een plantenpulp eventueel wiet (cannabis sativa) zou kunnen zijn en dat het niet om een hopplant gaat? met behulp van primers en blasten door NCBI en elektroforese. We moeten dit namelijk gaan uitvoeren maar lopen helemaal vast In ieder geval alvast bedankt!
Dat is wel een heel brede vraag - wellicht kun je eerst beter inlezen hoe het aantonen van dna middels pcr (en analyse op gel) in het algemeen wordt uitgevoerd?
Dat kan een goede manier zijn. Idealiter ontwikkel je ook nog een primer set voor een gen wat zowel in hop als cannabis aanwezig is. Dit kan dan dienen als positieve controle dat er inderdaad DNA in het sample aanwezig is.
Daar zullen geheid primers voor beschikbaar zijn - er zijn genoeg genen die in (vrijwel) iedere plant te vinden zijn.
Voor wat cannabis betreft: de sequentie van thc acid synthase en het ervoor coderende gen zijn voor zover ik weet opgehelderd, dus primers daarvoor vinden of laten maken zal niet zo'n groot probleem zijn.
Ja we hebben inderdaad zelf primers ontwikkeld en primers uit een artikel gehaald die wiet zeker weten aan moeten tonen. We krijgen ook een wiet monster. Maar we moeten DNA eerst isoleren en DNA concentratie bepalen m.b.v. Nanodrop, welke zou je dan eerst moeten doen?