nomenclatuur microbiologie

[janny]

Hallo,

ik heb geen echte microbiologie achtergrond en snap niet helemaal hoe de nomenclatuur van stammen werkt.

Bv: stam B2155

thrB1004 pro thi strA hsdsS lacZD M15 (F`lacZD M15 lacI^q traD36 proA⁺ proB⁺) D dapA::erm (Erm^r) pir::RP4 [::kan (Km^r) from SM10]

An E. coli strain carrying the pir sequence required for maintenance of plasmids containing R6K ori. Also, this strain is auxotrophic for DAP (diaminopimelic acid - a lysine precursor). The auxotrophy helps in removal of this strain from a bi-parental mating setup after conjugation.

wat betenkt die pir::RP4 ? Is dit dat RP4 geintegreerd is in het pir gen? Zoja: hoe komt het dat dit pir gen nog actief is? (Er staat dat het de pir sequentie nog heeft voor R6K plasmiden, ookal zit er RP4 in?)

En een tweede vraag: wat beteken die [] haakjes?

En die :: voorkan? Wil dit zeggen dat kan geintegreerd is in het RP4 gen?